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海洋聚苯乙烯(PS)塑料降解微生物及其代谢机制
发布日期:2024-03-04
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聚苯乙烯(PS)是海洋环境中最常见的塑料污染物之一。PS由于其高分子量和高结构稳定性,通常被认为是不可降解的。废弃的PS制品往往只能分解成微小的颗粒,成为微塑料,被海洋生物误食,从而进入食物链,对海洋生态系统和人类健康造成危害。此外,聚苯乙烯本身可能释放出有毒物质,进一步加剧了海洋环境的污染问题。该团队围绕海洋环境塑料降解微生物开展了系统研究,发现并获得了多种塑料的降解微生物,并对其代谢机制进行了研究。

01

研究内容

1. 红树林环境中EPS废弃物的细菌多样性

随机选取红树林滨海带EPS塑料废弃物样品进行16s rRNA基因测序,原位观察细菌群落。分类分析表明,EPS废弃物具有较高的细菌多样性和丰富度(图1)。基于3份EPS废弃物的27138个序列,共检测到细菌38门、92纲、246目、398科、634属和2745个OTUs。在科水平上,丰度排名前3的科依次为Woeseiaceaenorank_o_SBR1031Cyclobacteriaceae

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图1 富集实验开始时随机选取的样品ZN13、ZN19和ZN20的原始群落多样性

2. 扫描电镜观察膜表面富集过程中EPS的生物降解情况

在第一轮富集结束时,可以看到所有富集培养物浑浊且呈淡黄色,这可能是由于初始样品表面有少量沉积物。第二轮富集后,富集液明显浑浊,但无颜色。显微镜下观察到,与富集前相比,富集后的生物量呈指数级增长。第二次富集后,随机选取一个富集样品进行SEM观察(图2)。在EPS表面观察到大量侵蚀凹坑,表明附着EPS的微生物生物膜具有活性。特别地,与对照组(图2b-c)相比,在EPS表面观察到高密度细菌和EPS碎片的生物膜(图2e-f)。附着和生物膜的形成可能是EPS降解的先决条件。

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图2 第二次富集完成后,用扫描电镜观察EPS的表面显微图

3. EPS实验室富集的细菌多样性

对10个EPS塑料样品进行三轮实验室富集,得到60个EPS降解菌群,并进行细菌群落分析。高通量测序显示,与初始菌相比,在第三轮富集结束时发生了显著变化(图3)。

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图3 第三轮富集中多个红树林来源的海洋PS塑料降解菌群及其细菌组成

4. 基于微生物α和β多样性分析的PS降解群落动态研究

富集过程中α-多样性(Chao 1和Shannon指数)与富集过程有关;此外,EPS表面(P1, P2, P3)和培养溶液(Y1, Y2, Y3)之间也存在显著差异(图4A-B)。β-多样性显示,在实验室中,微生物群落结构在第一次和第二次富集时发生显著变化,而在第二次和第三次富集时没有变化(图4C-D)。这说明随着PS的富集过程,细菌群落结构趋于稳定。

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图4 微生物群落的α-多样性和β-多样性

5.微生物网络分析其潜在的关键类群

根据MENA分析,60个样品中富集细菌群落的整体网络显示出不同的共生模式(图5)。在整个网络中,选择了ProteobacteriaBacteroidotaActinobacteriotaPatescibacteria四个门的12个OTUs作为网络枢纽的重点分类群。在整个网络中,有5个关键类群属于变形菌门,包括PseudomonadalesRhodobacteralesSphingomononadalesOceanospirillalesRhizobiales,其中SphingomonadalesRhizobialesRhodobacterales经常出现在塑料表面。

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图5 PS富集菌群的微生物网络分析。节点的颜色表示不同的优势门,边缘的颜色表示节点之间的正(绿色)或负(红色)相关。

6. PS降解微生物分离株的筛选

选择4个菌株进行PS降解分析,包括Gordonia sp. ZN14R1,Gordonia sp. ZN15R9,Gordonia sp. ZN17RX和Novosphingobium sp. ZN18A2,它们在以PS膜为唯一碳源的MMC培养基中生长速度更快。SEM观察发现,所有降解PS的菌株在PS表面形成致密的生物膜,经过15天的培养后紧密附着在PS表面,导致塑料表面凹陷甚至断裂(图6A-B)。第30天,PS表面明显被侵蚀,形成了微生物定植的凹坑(图6C),塑料表面形成生物膜被认为有利于生物降解和细菌增殖。微生物寄生形成的侵蚀坑表明PS的降解是由微生物活性介导的。经过30天的培养,生物膜上以绿色的活细胞为主,而在荧光下只观察到一小部分红色的死细胞 (图6D)。生物膜中活细胞的优势再次证实,这些细胞通过分解和代谢塑料在PS上生存。

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图6 ZN14R1、ZN15R9、ZN17RX和ZN18A2S的PS塑料降解表征。A与图B,SEM观察附着在PS上形成生物膜的定居菌落与未接种的PS (CK)相比;图C,去除细菌生物膜后,展示出塑料表面的破损。

7. 实验验证PS的生物降解

PS表面物理性质的变化:通过水接触角分析微生物降解PS后表面疏水性的变化。如图7所示,用2% SDS去除PS表面的生物膜并干燥后,菌落孵育的PS膜表面接触角< 80°远低于未孵育对照的接触角(平均= 91.48°)。

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图7 水滴与PS表面接触角的变化

ATR-FTIR检测PS的生物降解:如图8所示,与未经处理的PS样品相比,微生物处理的PS样品中650-1000 cm-1(环弯曲振动)的FTIR峰强度要弱得多。生物降解的进一步证据是,PS的峰特征强度和羰基的出现(C=O拉伸,1731 cm-1)以及与C-O拉伸相关的峰(1050-1250 cm-1)的下降。在菌落样品的所有FTIR光谱中,2700-3000 cm-1处的峰展宽与C-H和/或醛基团有关。

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图8 Gordonia sp. 和 Novosphingobium sp.生物降解和氧化PS聚合物的表征

02

总结

聚苯乙烯(PS)是一种广泛应用于人类生活和工业生产的塑料,但由于其难降解性,导致了严重的环境问题,PS与其他塑料污染物一起也对海洋环境系统造成了污染。该研究首次报道了海洋聚苯乙烯塑料降解微生物,它们在海洋环境中对去除PS污染物起到关键作用,也丰富了塑料降解微生物的多样性。

供稿:康方冰

   编辑:汪禹彤 王晓彤 刘保月

 责任编辑:苏田源 崔志勇